한국파스퇴르연구소는 2016년 한해도 과학 꿈나무들에게 생명과학 및 기초과학 분야를 탐구하고 흥미를 북돋아 주기 위해 다양한 교육 프로그램을 진행했다. 경기도 경기과학멘토 사업과 미래창조과학부의 지원으로 진행된 한국파스퇴르연구소 교육 프로그램은 2016년 한해 동안 총 62회 진행되었으며, 3,078 명이 그 혜택을 받았다.

초등학생부터 대학생에 이르기까지 모든 연령이 참여할 수 있는 연구소 교육 프로그램은 과학자들이 직접 가르쳐주는 과학 이론 수업 및 실험 뿐만 아니라 질문 세션, 연구소 투어 등 다양한 형태로 구성되어 있어 과학과 연구소 역할을 직접 체험할 수 있다.  또한 안양과 동두천에서 진행된 과학 페스티발에도 참석, 일반인들도 손쉽게 과학을 체험하고 접할 수 있도록 다양한 프로그램을 선보여 과학문화 확산에도 앞장섰다.

특히, 여름/  겨울 방학 동안 학부생들을 대상으로 진행되는 연구소 인턴쉽 프로그램의 경우, 생명과학을 전공하는 학생들이 연구소에서 일하면서 교육을 받을 수 있도록 특별히 고안되었다. 학생들은 각 연구팀에 배정되어 과학자와 함께 연구하며 과학자의 역할과 책임에 대해 배우게 되며,  또한 실험을 직접 해봄으로 미래 진로를 경험할 수 있다. 중고생을 위한 교육 프로그램 역시 생명과학에 대한 이해를 높일 수 있는 다양한 강의 및 실습 프로그램과 과학자와의 대화 시간으로 구성되어 있다. 아이들은 이런 과정을 통해 과학이 일상에서 어떤 역할을 하는지 이해하고, 과학과 기초과학 분야를 더 공부하기 위해 무엇이 필요한지를 이해함으로 미래 대한민국 과학자를 길러내는 중요한 밑거름이 되고 있다.

교육은 루이 파스퇴르가 강조한 부분 중 하나로 한국파스퇴르연구소는 2009년부터 꾸준히 과학 교육 프로그램을 진행하고 있다. 올해까지 약 16,500 여명의 학생들이 생명과학 교육 혜택을 받았다. 2017년에도 한국파스퇴르연구소는 계속해서 다양한 과학 교육 프로그램과 인턴쉽 프로그램을 제공할 것이다.